Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF1DQ9H5J8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms