Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TM6SF1Q9BZW5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM6SF1Q9BZW5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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