Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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