Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms