Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf16Q9BUW7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf16Q9BUW7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms