Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms