Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTA3Q9BTC8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms