Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LARP6Q9BRS8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LARP6Q9BRS8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms