Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms