Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TREX2Q9BQ50 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TREX2Q9BQ50 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms