Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP8Q99708 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms