Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORT1Q99523 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORT1Q99523 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms