Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms