Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRBNQ96SW2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms