Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLCC1Q96S66 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms