Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SFXN2Q96NB2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms