Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM227BQ96M60 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms