Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC74BQ96LY2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms