Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COG3Q96JB2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms