Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RNFT2Q96EX2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RNFT2Q96EX2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms