Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPDL1Q96EA4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms