Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCTD12Q96CX2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCTD12Q96CX2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCTD12Q96CX2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCTD12Q96CX2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms