Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAVIN3Q969G5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms