Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCAF4Q8WV16 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms