Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYRIPQ8NFW9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYRIPQ8NFW9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms