Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEST4Q8NFU0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms