Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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