Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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ZNF439Q8NDP4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF439Q8NDP4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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