Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC197Q8NCU1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC197Q8NCU1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms