Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD53Q8N9V6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms