Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms