Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms