Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD1Q6UXZ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms