Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCBE1Q6UXH8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms