Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMCO3Q6UWJ1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCO3Q6UWJ1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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