Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRSAM1Q6UWE0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRSAM1Q6UWE0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRSAM1Q6UWE0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRSAM1Q6UWE0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRSAM1Q6UWE0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRSAM1Q6UWE0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRSAM1Q6UWE0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRSAM1Q6UWE0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRSAM1Q6UWE0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRSAM1Q6UWE0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms