Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KANK3Q6NY19 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KANK3Q6NY19 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms