Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KRT80Q6KB66 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT80Q6KB66 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms