Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS3Q68E01 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INTS3Q68E01 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms