Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms