Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM41BQ5BJD5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms