Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSD17B12Q53GQ0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms