Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TWISTNBQ3B726 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms