Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FSCN1Q16658 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms