Protein–RNA interactions for Protein: Q16643

DBN1, Drebrin, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBN1Q16643 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DBN1Q16643 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms