Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTF1Q16619 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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