Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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