Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCSK7Q16549 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCSK7Q16549 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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