Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TNXAQ16473 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNXAQ16473 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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