Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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GABRA6Q16445 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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GABRA6Q16445 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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GABRA6Q16445 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GABRA6Q16445 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GABRA6Q16445 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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GABRA6Q16445 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA6Q16445 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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